Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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COL24A1Q17RW2 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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COL24A1Q17RW2 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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COL24A1Q17RW2 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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COL24A1Q17RW2 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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