Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms