Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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