Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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