Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RAB39AQ14964 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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RAB39AQ14964 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RAB39AQ14964 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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