Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CNGB1Q14028 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms