Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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