Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CACNA1SQ13698 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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