Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4AQ13619 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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