Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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