Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PROX1-AS1-203ENST00000451396 476 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 HNRNPA1P44-201ENST00000503999 879 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AP000879.2-201ENST00000530525 497 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OR4C7P-201ENST00000533375 919 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF577-201ENST00000301399 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TMEM45A-201ENST00000323523 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CHODL-203ENST00000400127 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms