Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 IL13RA2-202ENST00000371936 1498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 YWHABP1-201ENST00000445359 727 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPN13Q12923 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPN13Q12923 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPN13Q12923 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPN13Q12923 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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