Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SREBF2Q12772 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms