Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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TTPAP49638 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTPAP49638 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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