Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms