Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LTBRP36941 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LTBRP36941 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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