Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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