Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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