Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
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