Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CEP290O15078 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
CEP290O15078 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
CEP290O15078 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
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CEP290O15078 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
CEP290O15078 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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