Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SNX15Q9NRS6 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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SNX15Q9NRS6 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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SNX15Q9NRS6 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SNX15Q9NRS6 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SNX15Q9NRS6 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SNX15Q9NRS6 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SNX15Q9NRS6 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SNX15Q9NRS6 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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SNX15Q9NRS6 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SNX15Q9NRS6 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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