Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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SAMD8Q96LT4 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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SAMD8Q96LT4 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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SAMD8Q96LT4 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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SAMD8Q96LT4 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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SAMD8Q96LT4 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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SAMD8Q96LT4 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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