Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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GTF3C6Q969F1 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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GTF3C6Q969F1 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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GTF3C6Q969F1 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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GTF3C6Q969F1 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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GTF3C6Q969F1 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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GTF3C6Q969F1 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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GTF3C6Q969F1 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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GTF3C6Q969F1 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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GTF3C6Q969F1 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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GTF3C6Q969F1 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GTF3C6Q969F1 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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