Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KCNT1Q5JUK3 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNT1Q5JUK3 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms