Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CDKN3Q16667 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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