Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms