Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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SYCP1Q15431 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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SYCP1Q15431 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SYCP1Q15431 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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