Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PDCD1Q15116 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms