Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGA7Q13683 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms