Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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CDH18Q13634 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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CDH18Q13634 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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CDH18Q13634 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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CDH18Q13634 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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CDH18Q13634 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CDH18Q13634 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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