Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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