Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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