Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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TOP3AQ13472 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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