Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms