Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms