Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTP4A2Q12974 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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PTP4A2Q12974 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTP4A2Q12974 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTP4A2Q12974 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTP4A2Q12974 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTP4A2Q12974 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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