Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
E2F1Q01094 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms