Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CENPFP49454 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CENPFP49454 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CENPFP49454 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CENPFP49454 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CENPFP49454 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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CENPFP49454 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CENPFP49454 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CENPFP49454 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CENPFP49454 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CENPFP49454 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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