Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
COPS7AQ9UBW8 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COPS7AQ9UBW8 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms