Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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