Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms