Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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FOXQ1Q9C009 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXQ1Q9C009 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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