Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms