Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 UTP15-202ENST00000508491 1828 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 VLDLR-AS1-201ENST00000416826 3167 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 OVGP1-201ENST00000369732 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 FRG2B-202ENST00000443774 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC092656.1-201ENST00000503243 2097 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 FMO8P-201ENST00000434461 1600 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 CTBP2P2-201ENST00000434549 1334 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 GULP1-202ENST00000409580 3544 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ETS1-204ENST00000526145 3389 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 HHAT-203ENST00000367010 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 C2orf42-205ENST00000420306 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 BSPH1-201ENST00000344839 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 CTH-201ENST00000346806 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ZDHHC11B-201ENST00000382776 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 GSG1-204ENST00000432710 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC008074.1-201ENST00000441630 723 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 UBE2F-SCLY-201ENST00000449191 951 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 CSNK1A1-206ENST00000515748 620 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ZFAND1-214ENST00000521287 772 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AL929601.1-202ENST00000551067 418 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC090502.1-203ENST00000551726 554 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ZIM2-202ENST00000593931 483 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC127070.5-201ENST00000623177 2104 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC073255.1-201ENST00000624149 177 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 STK32A-209ENST00000626951 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AC135068.10-201ENST00000638015 913 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 GRXCR2-202ENST00000639411 837 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 THBS3-210ENST00000541576 3200 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ZNF780A-202ENST00000414720 2396 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 HGF-209ENST00000457544 2249 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 KLF8-204ENST00000468660 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 SLC28A2-201ENST00000347644 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 MASP1-202ENST00000296280 4015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 MOSPD1-203ENST00000370783 2364 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 AMPD3-202ENST00000396553 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KCTD12Q96CX2 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.8 ms