Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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