Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms