Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
ALCAMQ13740 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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