Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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