Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms