Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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TCIRG1Q13488 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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TCIRG1Q13488 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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